在防治工业污染和综合治理城市环境方面，中国依靠强化监督管理和技术进步手段推动环境保护事业的发展。1999年，完成环境污染限期治理项目22258个，总投资123.1亿元；在536个城市中建成了2364个烟尘控制区；在431个城市中，建成了2040个环境噪声达标区。重点流域和区域污染防治工作全面展开。对滇池流域日排废水100吨以上的144家排污企业进行了限期治理。对巢湖流域日排放100吨以上的109家排污企业进行了限期治理。滇池和巢湖已基本实现全流域工业污染源达标排放的目标，水质有所好转。